DIGE — 雙向螢光差異凝膠電泳(Two-dimensional fluorescence difference gel electrophoresis,2D-DIGE)，是在傳統雙向電泳的基礎上發展而來的新型蛋白質組學定量技術，其分離蛋白質混合的原理與雙向電泳是一致的，主要利用蛋白質的等電點和分子量的差異來分離蛋白質混合物，同時應用螢光染料的靈敏度及內標的使用等技術，使其在定量蛋白質組學的研究中效果明顯優於傳統雙向電泳。
DIGE使用的螢光染料有Cy2, Cy3和Cy5，它們能與蛋白質的賴氨酸側鏈氨基反應而使蛋白質被標記，被標記蛋白質的等電點和分子量幾乎不受影響，等量混合標記好的蛋白質後進行雙向電泳，不同凝膠之間可以通過cy2內標匹配，消除凝膠之間的差異，蛋白質表達量的變化則通過cy3和cy5不同螢光的強度來體現。
與常規雙向電泳後，銀染或考染膠相比，DIGE具有以下優勢：
1、靈敏度高，蕞低可檢測到125pg的蛋白質；
2、高效性，同一塊凝膠上可以電泳兩個樣品，減輕了工作量；
3、線性範圍更廣,動態範圍高達10-5；
4、定量精確, 採用內標消除了凝膠與凝膠之間的實驗誤差，顯著提高了實驗的精確度和可重複性；
5、統計學分析，ImageMaster7.0（DIGE）軟體可以得到統計學可信的結果，降低了操作者之間的偏差。